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La presente investigación está orientada a identificar deficiencias que los estudiantes presentan en la ejecución de la auditoría informática dentro de la asignatura Auditoría de Sistemas de Información y a la vez elaborar una metodología que les permita la formación de las habilidades necesarias para auditar sistemas informáticos dentro de la asignatura Auditoria de Sistemas de Información. Los métodos y técnicas utilizados en el proceso fueron: encuestas, entrevistas estandarizadas individuales y grupales. Por medio de convenientes instrumentos se llegó a conocer las dificultades con respecto al proceso formativo vigente, permitiendo diagnosticar la situación actual en auditoría de sistemas de información. Por otra parte, el método de consulta a especialistas sirvió para valorar los resultados obtenidos y el procesamiento estadístico de los datos recopilados. Se trabajó con una población de  12 estudiantes de la asignatura Auditoría de Sistemas de Información, Universidad APEC.   El aporte de la tesis consiste en una metodología adecuada que cumpla con los requerimientos empresariales de acuerdo a las normas internacionales en la auditoría de sistemas de información que se manifiesta en un campo de acción particular de una carrera, como centro de un perfeccionamiento curricular basado en un proceso de formación de habilidades.   Los resultados fundamentales del presente trabajo están representados, por el diseño de una metodología que permite formar la habilidad de auditar sistemas informáticos dentro de la asignatura Auditoría de Sistemas de Información, y una colección de situaciones identificables como casos de estudio que facilitan su aplicación. Se sugiere desarrollar investigaciones en las clases y en toda la carrera, con el propósito  de conseguir un egresado competente, que cumpla con el perfil de profesional que espera la sociedad